आप ज्योथन से शुद्ध पायथन मॉड्यूल का उपयोग कर सकते हैं। आप उन मॉड्यूल का उपयोग नहीं कर सकते जो सी में लागू किए गए हैं। अपने पाइप इंस्टॉल से मॉड्यूल का उपयोग करने के लिए, आपको अजगर के sys.path को ज्योथन में जोड़ना होगा क्योंकि ज्योथन स्वचालित रूप से पायथनपैथ जानकारी नहीं लेता है
Jython 2.5 ने JYTHONPATH पर्यावरण चर को PYTHONPATH के Jython-समतुल्य के रूप में पेश किया, इसलिए दोनों को समान मान पर सेट करने से अधिकांश उपयोग के मामलों के लिए चाल चलनी चाहिए (जब तक कि आप असंगत Python और Jython संस्करणों के साथ सेटअप में काम नहीं कर रहे हों)।
अब आप सीधे ज्योथन में 'आयात' का उपयोग करके स्थानीय रूप से स्थापित पायथन मॉड्यूल आयात कर सकते हैं।